Joe Thorton est un attaquant de puissance et occupe la position de joueur de centre. Il a connu sa meilleure saison en 2005-06 avec une récolte de 125 points (29 buts et 96 passes en 81 matchs avec un ratio de + 31). Durant le lockout lors de la saison LNH 2004-05, il a joué avec le club de hockey HC Davos, avec qui il a remporté le championnat de Suisse de hockey sur glace et la Coupe Spengler. Lors de l'été 2005, Thornton a paraphé un contrat de trois ans d'une valeurs de 20 millions de dollars US avec les Bruins. Il a toutefois été échangé aux Sharks de San José le 30 novembre 2005, soit seulement moins de deux mois après l'ouverture de la saison. Les Bruins ont reçu en retour les attaquants Marco Sturm et Wayne Primeau ainsi que le défenseur Brad Stuart.
Récompenses :
* 2002 - Participation au match des étoiles de la LNH
* 2003 - Nommé au sein de la deuxième équipe d'étoiles de la LNH
* 2003 - Participation au match des étoiles de la LNH
* 2006 - Gagnant du Trophée Art Ross.